（一）申办机构认证动物防疫、动物防疫监督机构，须在规定期限内，持政府编委的机构成立人员配置批文、财政部门的经费指标批件、物价部门的行政事业收费许可证、财政部门的罚没款许可证等材料原件及复印件（加盖单位及主管部门公章）向所在地畜牧兽医行政主管部门提出申请，并填写辽宁省动物防疫、动物防疫监督机构资格认证登记表（一式三份）；
（二）市畜牧兽医行政主管部门收到动物防疫、动物防疫监督机构认证登记表后7日内，组织有关专家（不得少于3人的奇数）进行资格初审，10日内做出初审意见，同意的以文件形式报省畜牧兽医行政主管部门，并附辽宁省动物防疫、监督机构资格认证登记表和相关资料；
（三）省畜牧兽医行政主管部门收到所有申报材料后30日内组织有关专家（不少于3人奇数）对申请单位进行审查和验收，通过资格认证的，以文件形式公布；核发《动物防疫机构资格认证书》、《动物防疫监督机构资格认证书》。
首次未通过认证的，限期整改，逾期仍未通过的一年内不再受理认证审请。